近年來，激烈的競爭使得DNA測序技術迅猛發(fā)展?，F在，一種叫做納米孔測序的技術猶如一匹黑馬闖入大家的視線，看起來很有潛力在競爭中拔得*。研究人員證明，他們可以在DNA鏈通過一個微小的孔時連續(xù)地讀出DNA的各個“化學字母”，這為研發(fā)解碼DNA就如同播音員閱讀自動收報機紙條般的測序儀鋪平了道路。這種的技術有可能將完整測出人類基因組的費用降低到1000美元以下，為個體化醫(yī)療帶來革命。 將基于遺傳學的診療及醫(yī)學帶入新的時代。
大多數的測序工作需要耗時數天。測序儀對DNA雙鏈進行復制，并利用熒光標記及其他成分進行修飾，從而對DNA鏈的堿基組成進行讀取。納米孔測序技術則無需這些額外的步驟，直接對未經修飾的DNA鏈進行讀取，從而有可能成為市面上快、便宜的測序技術。
這個想法—使DNA鏈通過小孔并然后讀取其堿基—初是在1996年由麻省及加州的研究人員提出來的。后來，科學家們解決了如何利用電荷使DNA通過嵌入在在薄膜上的帶小孔蛋白質。當DNA堿基通過孔時，它們使電荷發(fā)生變化。靈敏的電子設備檢測到這些變變化從而鑒定所通過的堿基。
不過，存在的一個主要的問題是，當薄膜施加電壓后，DNA通過納米孔的速度過快而難以對序列上的堿基進行讀取。兩年前，加州大學的Mark Akeson和同事們偶然發(fā)現了一個可能的解決方案。他們將一種叫做phi29的蛋白質添加到納米孔裝置中。這種蛋白質在DNA運動通過納米孔時可與DNA形成松散的結合，從而使DNA的運動速度慢了下來。
近，華盛頓大學的物理學家Jens Gundlach所的一個研究團隊在Nature Biotechnology上報道稱，他們將Akeson的phi29蛋白整合至他們的納米孔設備，這種納米孔設備使用了一種不同的孔蛋白，可更快速地鑒定四種堿基。Phi29蛋白使DNA速度下降，使得每秒通過納米孔的核酸堿基數為20至30個，從而有可能對每一個經過納米孔的堿基進行識別。“這是納米孔測序的獨門絕技” Gundlach說。
該技術將加劇與另外一家叫做Oxford Nanopore Technologies公司的納米孔測序技術的競爭。在2月份，Oxford Nanopore Technologies公司宣稱，他們可以對通過一個單獨納米孔的DNA鏈進行完整的測序，并且有可能在2013年早期發(fā)售可同時運行數千個納米孔的測序儀，從而有可能將全基因組測序時間縮短到15分鐘，費用降到1000美元左右。
大多數的科學家認為，如果消息不假，這個技術則確實是個了不起的。不過他們仍舊在等待證明。“Oxford Nanopore首先發(fā)出了宣告，但是由于沒有公布足夠數據而受到嚴厲批評，”圣地亞哥的Electronic BioSciences公司總裁、化學家Geoffrey Barrall說。相反，Barrall說，Gundlach和同事們的成果看起來很有說服力。“這是*篇真正進行了DNA測序的文章。
